Android 4.1 Jelly Bean ile çalışan Xperia Z, Android 4.2'ye göre eksiklerini Sony'nin optimizasyonları ile geri kazanıyor. Sony'nin sunduğu işlevler arasında Xperia Z'nin iyi kamera yazılımı, görsel tema geçişi yapabilme, Sony'nin kendi hareket tabanlı yazma sistemi, NFC araçları ve fazlası var.