PCI-Express için çalışan geliştirme grubu üçüncü versiyonun spesifikasyonlarını tanımlamaya başladı.
En önemli yenilik ciddi derecede yükseltilmiş bir veri transferi oranı olacak: Versiyon 3'te 8 GT/s (saniyede 8 giga-transfer) mümkün olacak. 2009'a kadar spesifikasyonlar hakkındaki görüşmeler bitmiş olacak; en erken 2010 da ilk uyumlu donanımlar bekleniyor.
Selef PCI-Express 2 ise hala pazarda yerini almış değil: 2007'nin 3. çeyreğinin sonunda bu yuvalara sahip ilk anakartlar çıkacak.